Indledning
En population er mange individer af samme slags inden for et afgrænset område. Populationsgenetik har til formål at undersøge hyppigheden af forskellige gener samt fordelingen af fænotyper og genotyper i forskellige populationer.
I denne opgave vil jeg gøre rede for Hardy-Weinbergs lov ved anvendelse af genpuljemodellen og sandsynlighedsregning.
Derudover vil jeg undersøge et PTC-forsøg og beregne allelfrekvenser og genotypefordelingen i klassen samt den danske population, og se om de er i Hardy-Weinberg ligevægt.
Jeg vil anvende binomialtest til at vurdere mine resultater i forhold til fordelingen i den danske befolkning.
Man kan ikke altid regne med at Hardy-Weinberg loven stemmer overens, så derfor vil jeg også inddrage eksempler hvor Hardy-Weinberg lovens forudsætninger bliver brudt og diskutere hvorfor den ikke altid holder og diskutere betydningen af det.
Indholdsfortegnelse
Resume 2
Redegørelse 2
Undersøgelse 3
• Binomialfordeling & Binomialtest 4
• Allelfrekvens & Genotypefrekvens 4
Diskussion 6
• Naturlig Selektion 6
• Genetisk Drift 6
Konklusion 6
Litteraturliste 7
Bilag 7
Optimer dit sprog - Læs vores guide og scor topkarakter
Uddrag
• Binomialfordeling & binomialtest
Man bruger binomialfordelingen, når man har et forsøg, der kun har to udfald: succes og fiasko, i vores tilfælde er det PTC-smager, eller ikke-smager.
Binomialfordelingen anvendes til at afgøre, om hypotesen er rigtig eller forkert. Binomialtesten er en test man bruger til at undersøge, om det er nødvendigt at forkaste sit resultat af binomialfordelingen.
Vores basiseksperiment går ud på at lave stikprøver på 24 individer (elever i klassen). X~B(n,p) Vores stokastiske variable (X) er individer med evnen til at smage PTC. (n) er vores antalsparameter
som i dette eksperiment er 13 (n) = antal elever positiv for evnen til at smage PTC). (p) er vores basissandsynlighed, som i dette tilfælde er 0,70 / 70%, da vi har taget udgangspunkt i at 70% af klassen kan smage PTC.
Så vores nulhypotese vil altså lyde på, at 70% af individerne fra klassen er PTC-smagere. Hvis vores nulhypotese ikke passer, skal den forkastes.
Jeg laver en tosidet binomialtest, med et signifikansniveau på 5, så mit kritiske område ligger på 2,5 på hver side.
Ved at beregne de kumulerede frekvenser, kan vi finde vores kritiske område og vores acceptområde.
Vi har valgt at have et signifikansniveau på 5, så vores kritiske områder er altså 2,5 hver side, tilsvarende 0.000-0,025 og 0,975-1,000 i tabellen. Dermed kan vi se at tallene 0-11 og 21-24 ligger i det kritiske område, mens 12-20 er i acceptområdet.
I og med at 0,70 ligger i acceptområdet, behøver vi ikke forkaste vores nulhypotese og dermed er vores undersøgelse i Hardy-Weinberg ligevægt.
Kurven beskriver fordelingen. X-aksen beskriver individerne, mens y-aksen beskriver de kumulerede frekvenser.
• Allelfrekvens & genotypefrekvens
Vi skal nu beregne allelfrekvenser. Vi kan starte med at beregne Danmarks befolkning hvor 70% er PTC-smagere, og 30% er ikke-smagere.
Hvis et individ har en genotype der er homozygot dominante eller heterozygot, kan individet godt smage. Hvis individet har en genotype som er homozygot recessiv, kan individet ikke smage.
Hvis vi vil beregne vores allelfrekvenser, kan vi bruge formlen, p2 + 2pq + q2 = 1, som kan bekræfte om populationen er i Hardy-Weinberg ligevægt.
Hvis jeg kender den ene genotype, kan jeg beregne den anden, fordi de tilsammen skal give 1, som nævnt i formlen.
Jeg kan altså starte med at finde den recessive allel, som i dette tilfælde er q og regne på den. q, står for de 30% der er ikke-smagere, så kigger vi tilbage på vores formel, må q2 være 0,30.
For at ophæve at q står i anden (q2), kan vi tage kvadratroden af 0,30 , som rundet op giver 0,55. Jeg kan nu finde p ved at sige 1-0,55=0,45.
Nu har vi fundet q som er 0,55 og p som er 0,45, og dermed har vi regnet allelfrekvenserne ud, så nu kan vi regne genotypefrekvensen ud.
Skriv et svar