Indholdsfortegnelse
6. Undersøg aminosyresekvenserne nærmere. Til venstre på siden kan man lave’Highlights’ efter aminosyrernes egenskaber.
a. Hvor mange aminosyrer er helt ens?
b. Hvilken betydning kan det tænkes at have at nogle af aminosyrerne i aminosyresekvenserne er ens?
7. Sammenlign det fylogenetiske stamtræ med træet side 172 i Genetikbogen b+a. Er de ens?
8. Prøv ’Highlight taxonomy’ (står lige under stamtræet).
a. Hvilke informationer får du her?
b. Sammenlign med informationerne om klassifikation og systematik beskrevet i side 161-163 i Genetikbogen.
9. Prøv at klikke på dyrenes navne i listen. Her kan du få vist fotos af de pågældende dyr.
10. Kør med pilen øverst til venstre i billedet tilbage til siden med din søgning på gamma-fibrinogen.
11. Udvid nu dit stamtræ ved at finde og markere (flueben) gamma-fibrinogen med længden 77 aminosyrer for gris (pig), lama (guanaco), dromedar (dromedary), delfin (dusky dolphin) og tapir (malayan tapir).
12. Klik på fanebladet ’Align’.
13. Undersøg følgende vedrørende det fylogenetiske stamtræ i det du også vælger ’highlight taxonomy’, som du kan gøre brug af for at besvare disse spørgsmål:
● Hvilket dyr er delfinen tættest beslægtet med? Hvilke udviklingsmæssige træk har de to dyr til fælles?
● Tapiren er udskilt kort efter hesten i dyrenes stamtræ. Undersøg hvilke morfologiske ligheder en tapir har til fælles med en hest.
● Hvilket dyr er lamaen tættest beslægtet med?
● Hvilke to dyr er grisen tættest beslægtet med?
● Hvor mange af dyrene i stamtræet har klove? Er de placeret i nærheden af hinanden?
● Stemmer dit stamtræ lavet ved hjælp af Uniprot overens med følgende stamtræ, som repræsenterer den anerkendte inddeling af pattedyrene (sammenlign fx ved hjælp af den taxonomiske liste som du kan få frem ved hvert dyr i dit Uniprot stamtræ):
Optimer dit sprog - Læs vores guide og scor topkarakter
Uddrag
Du får nu et ’alignment’, altså en sammenligning, der indeholder følgende:
a. En sammenstilling af amino sekvenserne for de fem pattedyr.
b. Et fylogenetisk stamtræ for de fem pattedyr.
c. En liste med informationer om resultaterne.
d. En liste der bl.a. fortæller dyrenes navne.
---
7. Sammenlign det fylogenetiske stamtræ med træet side 172 i Genetikbogen b+a. Er de ens?
- Det fylogenetiske stamtræ og træet i bogen viser den genetiske afstand. I dette tilfælde kan vi se i bogen at figuren viser, at giraffen og fåret har relativt meget til fælles fordi deres genetisk afstand er den samme og det er nok fordi de har morfologiske ligheder som er at de begge er klovdyr, og at de er planteæder.
- Hvis vi kigger på det fylogenetiske stamtræ og træet i bogen så er den opbygget på en anden måde, hvor den genetiske afstand er mere tydeliggjort. I bogen kan vi se at giraffen og får har den samme genetisk afstand, og det har de også i vores stamtræ.
Hesten og ulven har ikke den samme genetisk afstand, men tallet er stadig tæt på hinanden. I vores stamtræ kan vi se at de er tættest beslægtet i forhold til de andre dyr, men der stadig lidt morfologiske forskelle.
- Stamtræet vi har lavet viser dyrene med aminosyresekvensen 77 med fibrigon proteinet.
Skriv et svar